農藥殘留檢測儀是根據國標GB/T5009.199-2003，采用酶抑制原理和光電比色法原理研制而成。在一定條件下，有機磷和氨基甲酸類農藥對膽堿酯酶正常功能有抑制作用，其抑制率與農藥的濃度呈正相關。正常情況下，酶催化神經傳導代謝產物（乙酰膽堿）水解，其水解產物與顯色劑反應，產生黃色物質，用農藥殘留檢測儀器測定吸光度隨時間的變化值，計算出抑制率，通過抑制率可以判斷出樣品中是否含有有機磷或氨基甲酸酯類農藥的存在，這就是農藥殘留檢測儀的工作原理。

　　農藥殘留檢測儀在檢測過程中可以同時測試多個樣品，每個樣品由程序控制分別獨立工作，不會互相干擾，在一定程度上減少了誤差。使用農藥殘留檢測儀對于檢測農產品中農藥殘留的含量起著十分重要的作用，對保護人體健康有著重要的意義。